MovableTypeは弊社でも以前は1社だけお使いだったのですが、
現在では皆さんWordPressになってしまいました。

お役に立てて光栄です。
引き続き、インクループを宜しくお願い致します。

当方、別の子ドメインにMovable Typeも入れております。
Movable Typeはサイト構築のときにHTMLを吐き出しますので、
その子ドメインも同じやり方で表示できると思っておりましたが、
何故か５００エラーが出てしまいます。。。
こちらの設定のために四苦八苦しましたが、解決に至らず。
ご返信が遅れてしまい申し訳ございません。
もうMovable Typeは辞めようかと思っております。

なんにせよ、大変たすかりました。ありがとうございます！

現状で分かる情報から判断すると、おそらくですが、
「sub2.com」ディレクトリ以下の.htaccessに

RewriteRule ^(.*)$ /%{HTTP_HOST}/$1/index.html [L]

を追記することで表示されるようになるのではないかと思います。
試していただだけますでしょうか？

どうぞ宜しくお願い致します。

当方の環境は以下のような感じです。

— 環境 ここから —

home（.htaccess設置）
├wp（.htaccess設置）⇒親ドメインのWordPress
│├wp-admin
│├wp-content
│└wp-includes
├sub1.com（.htaccess設置）⇒サブドメインのWordPress
│└wp
│ ├wp-admin
│ ├wp-content
│ └wp-includes
└sub2.com（.htaccess設置）⇒静的HTMLページ
　├index.html
　└aaa
　　└index.html

— 環境 ここまで —

記事にあります通り、
RewriteRule ^(.*)$ /%{HTTP_HOST}/$1/index.php [L]
これを記述することで、子ドメイン（sub1.com）のwordpressの問題は解決しました。

しかしながら、
http://sub2.com
が表示されなくなってしまいました。。。

ここにはindex.phpは置いておらず、
代わりにindex.htmlがあります。

また、
http://sub2.com/index.html
と打ち込めば表示されます。

なんとか解決方法をご教授願えませんでしょうか？
どうぞ、よろしくお願い申し上げます。